Ústav provozuje vědeckovýzkumnou, vědecko-metodickou, vědecko-vzdělávací a informační a vydavatelskou činnost. Hlavním cílem činnosti ústavu je provádění a koordinace základního a aplikovaného výzkumu ve sféře vzdělávání, zpracování vědeckého a metodického zajištění fungování a rozvoje národního systému vzdělávání.